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作者 標題 [新聞] 紐約地鐵存在大量與人類不匹配的DNA
時間 Thu Feb 19 20:12:59 2015
紐約地鐵存在大量與人類不匹配的DNA
紐約時報 http://cn.tmagazine.com/health/20150217/t17nysubway/zh-hant/
生活ELIZABETH A. HARRIS 2015年02月17日
你在地鐵上有沒有見到過某種你不太認識的東西——某種神秘的無法辨認的東西?
呃,科學家們很可能也不知道它是什麼。
周四,韋爾· 康奈爾醫學院(Weill Cornell Medical College)的研究者們公布了一項研
究,他們繪製了紐約地鐵系統的DNA圖譜。這個擁擠的地下龐然大物每個工作日平均運送
550萬乘客,這裡有上千種細菌(大多是無害的),偶爾還能找到腺鼠疫的痕迹,這是個
謎一般的世界。在紐約地鐵系統中發現的DNA中,有近一半與已知的所有微生物都不匹配
,只有0.2%與人類的基因組匹配。
究,他們繪製了紐約地鐵系統的DNA圖譜。這個擁擠的地下龐然大物每個工作日平均運送
550萬乘客,這裡有上千種細菌(大多是無害的),偶爾還能找到腺鼠疫的痕迹,這是個
謎一般的世界。在紐約地鐵系統中發現的DNA中,有近一半與已知的所有微生物都不匹配
,只有0.2%與人類的基因組匹配。
「人們看着地鐵上的扶手柱,原本不會心想, 『這上面滿是生命,』」 這項研究的主要
作者、韋爾· 康奈爾醫學院的遺傳學家克里斯托弗· E· 梅森博士(Christopher E.
Mason)說,「看完這項研究後,他們可能會開始這樣想。但是我想讓他們以看待雨林的眼
光看待地鐵,這裡有這麼多物種,但是並沒有影響你的健康,簡直令人敬畏和驚嘆。」
梅森說,大約四年前,他產生了進行這項研究的想法。當時他把女兒送去日托所。他發現
,她探索新環境的方式是高興地把東西丟到嘴裡品嘗。小孩子的友誼都是在地板上建立起
來的,來回交換玩具,你啃完我啃。
,她探索新環境的方式是高興地把東西丟到嘴裡品嘗。小孩子的友誼都是在地板上建立起
來的,來回交換玩具,你啃完我啃。
「我忍不住想,『他們之間究竟傳遞了哪些東西,又傳遞了多少?』」梅森說。所以他想
到了一個地方,一個成年人可能靠得太近的地方——地鐵。
於是,這個被稱為PathoMap的項目就誕生了。在過去的17個月中,一個主要由醫學院學生
、畢業生和志願者組成的團隊在城裡四散開來,他們用尼龍簽子從木板凳、樓梯扶手、座
位、門、柱子和旋轉門等各種物體表面收集一式三份的DNA。
、畢業生和志願者組成的團隊在城裡四散開來,他們用尼龍簽子從木板凳、樓梯扶手、座
位、門、柱子和旋轉門等各種物體表面收集一式三份的DNA。
除了大量神秘的DNA——這並不令人意外,因為科學家們僅繪製出了幾千個基因組——這
項研究的其他發現還反映出紐約在人種和微生物方面著名的多樣性。
結果發現,從微生物種類角度講,布朗克斯區最多樣化。布魯克林區排第二,接下來是曼
哈頓區、皇后區和斯塔滕島(研究者是在斯塔滕島的火車上收集樣本的)。
梅森博士說,從人的角度講,在某些情況下,在某些地鐵站找到的DNA與其周圍的人口情
況相符。比如,曼哈頓中國城附近有個西班牙裔聚居區,這裡的地鐵站里有大量西班牙和
亞洲基因。
況相符。比如,曼哈頓中國城附近有個西班牙裔聚居區,這裡的地鐵站里有大量西班牙和
亞洲基因。
布魯克林區展望公園(Prospect Park)南部主要包括肯辛頓和溫莎,這附近收集的DNA大多
被解讀為英國後裔、托斯卡納後裔和芬蘭後裔,人們通常不會把這三個人群與這個區聯繫
在一起。梅森對這個發現的解釋是:科學家們還沒有建立起值得信賴的愛爾蘭基因數據庫
,所以住在這裡的愛爾蘭後裔的DNA可能被誤認為是其他歐洲人群的,因為他們的DNA有很
多相似之處。這項研究還發現了一些不那麼令人愉快的情況。在收集到的樣本中,有27%
是活性耐葯細菌,雖然在收集到的所有細菌中,只有12%與疾病相關。研究者還發現了三
個與腺鼠疫相關的樣本和兩個與炭疽的DNA片段相關的樣本,不過他們指出,這些樣本都
沒有活性,有很長一段時間,紐約都沒有出現過這兩種疾病的確診案例。梅森說,「紐約
州和東海岸有很多記錄在案的牲畜炭疽病例」,在紐約地鐵上發現炭疽樣本「與這一情況
吻合」。
被解讀為英國後裔、托斯卡納後裔和芬蘭後裔,人們通常不會把這三個人群與這個區聯繫
在一起。梅森對這個發現的解釋是:科學家們還沒有建立起值得信賴的愛爾蘭基因數據庫
,所以住在這裡的愛爾蘭後裔的DNA可能被誤認為是其他歐洲人群的,因為他們的DNA有很
多相似之處。這項研究還發現了一些不那麼令人愉快的情況。在收集到的樣本中,有27%
是活性耐葯細菌,雖然在收集到的所有細菌中,只有12%與疾病相關。研究者還發現了三
個與腺鼠疫相關的樣本和兩個與炭疽的DNA片段相關的樣本,不過他們指出,這些樣本都
沒有活性,有很長一段時間,紐約都沒有出現過這兩種疾病的確診案例。梅森說,「紐約
州和東海岸有很多記錄在案的牲畜炭疽病例」,在紐約地鐵上發現炭疽樣本「與這一情況
吻合」。
這項研究的作者們說,進行這項研究的目的不僅是為了滿足科學家們的好奇心。研究者們
現在把這些物種歸類,將來就可以把它們用作對照樣本,以確定某些疾病甚至某些用作生
物恐怖主義武器的物質是否已擴散。
現在把這些物種歸類,將來就可以把它們用作對照樣本,以確定某些疾病甚至某些用作生
物恐怖主義武器的物質是否已擴散。
城市和交通官員們似乎並不歡迎這項研究。
「就像這項研究清楚表明的那樣,在物體表面發現的那些微生物對人的生命和健康毫無危
害,」紐約大都會運輸署發言人凱文· 奧爾蒂斯(Kevin Ortiz)在郵件中說。紐約衛生部
稱這項研究「有重大缺陷」,具有誤導性。
害,」紐約大都會運輸署發言人凱文· 奧爾蒂斯(Kevin Ortiz)在郵件中說。紐約衛生部
稱這項研究「有重大缺陷」,具有誤導性。
梅森對此的回復是,他和他的團隊只是呈現出他們的全部研究結果。
「對我們來說,在全面分析的情況下,不報告炭疽DNA片段和黑死病是不負責任的,」他
說,「我們的發現展示了一個正常、健康的微生物群,我們歡迎其他人複核這些公開發布
的數據,進行同樣的分析。」
說,「我們的發現展示了一個正常、健康的微生物群,我們歡迎其他人複核這些公開發布
的數據,進行同樣的分析。」
本文最初發表於2015年2月6日。
翻譯:王相宜
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推 : 你的基因沒有問題1F 02/19 20:13
→ : 五樓的義大利2F 02/19 20:13
推 : 外星人3F 02/19 20:14
推 : MIB是真的4F 02/19 20:14
推 : 有找到肥宅的基因嗎5F 02/19 20:14
推 : 是四隻烏龜跟一隻老鼠的嗎?6F 02/19 20:14
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→ : 靠原來大家都看過XD
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