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作者 rocfrank (roc_frank™ )
標題 [新聞] 紐約地鐵存在大量與人類不匹配的DNA
時間 Thu Feb 19 20:12:59 2015


紐約地鐵存在大量與人類不匹配的DNA

紐約時報 http://cn.tmagazine.com/health/20150217/t17nysubway/zh-hant/

生活ELIZABETH A. HARRIS 2015年02月17日

你在地鐵上有沒有見到過某種你不太認識的東西——某種神秘的無法辨認的東西?

呃,科學家們很可能也不知道它是什麼。

周四,韋爾· 康奈爾醫學院(Weill Cornell Medical College)的研究者們公布了一項研
究,他們繪製了紐約地鐵系統的DNA圖譜。這個擁擠的地下龐然大物每個工作日平均運送
550萬乘客,這裡有上千種細菌(大多是無害的),偶爾還能找到腺鼠疫的痕迹,這是個
謎一般的世界。在紐約地鐵系統中發現的DNA中,有近一半與已知的所有微生物都不匹配
,只有0.2%與人類的基因組匹配。


「人們看着地鐵上的扶手柱,原本不會心想, 『這上面滿是生命,』」 這項研究的主要
作者、韋爾· 康奈爾醫學院的遺傳學家克里斯托弗· E· 梅森博士(Christopher E.
Mason)說,「看完這項研究後,他們可能會開始這樣想。但是我想讓他們以看待雨林的眼
光看待地鐵,這裡有這麼多物種,但是並沒有影響你的健康,簡直令人敬畏和驚嘆。」

梅森說,大約四年前,他產生了進行這項研究的想法。當時他把女兒送去日托所。他發現
,她探索新環境的方式是高興地把東西丟到嘴裡品嘗。小孩子的友誼都是在地板上建立起
來的,來回交換玩具,你啃完我啃。


「我忍不住想,『他們之間究竟傳遞了哪些東西,又傳遞了多少?』」梅森說。所以他想
到了一個地方,一個成年人可能靠得太近的地方——地鐵。

於是,這個被稱為PathoMap的項目就誕生了。在過去的17個月中,一個主要由醫學院學生
、畢業生和志願者組成的團隊在城裡四散開來,他們用尼龍簽子從木板凳、樓梯扶手、座
位、門、柱子和旋轉門等各種物體表面收集一式三份的DNA。


除了大量神秘的DNA——這並不令人意外,因為科學家們僅繪製出了幾千個基因組——這
項研究的其他發現還反映出紐約在人種和微生物方面著名的多樣性。

結果發現,從微生物種類角度講,布朗克斯區最多樣化。布魯克林區排第二,接下來是曼
哈頓區、皇后區和斯塔滕島(研究者是在斯塔滕島的火車上收集樣本的)。

梅森博士說,從人的角度講,在某些情況下,在某些地鐵站找到的DNA與其周圍的人口情
況相符。比如,曼哈頓中國城附近有個西班牙裔聚居區,這裡的地鐵站里有大量西班牙和
亞洲基因。


布魯克林區展望公園(Prospect Park)南部主要包括肯辛頓和溫莎,這附近收集的DNA大多
被解讀為英國後裔、托斯卡納後裔和芬蘭後裔,人們通常不會把這三個人群與這個區聯繫
在一起。梅森對這個發現的解釋是:科學家們還沒有建立起值得信賴的愛爾蘭基因數據庫
,所以住在這裡的愛爾蘭後裔的DNA可能被誤認為是其他歐洲人群的,因為他們的DNA有很
多相似之處。這項研究還發現了一些不那麼令人愉快的情況。在收集到的樣本中,有27%
是活性耐葯細菌,雖然在收集到的所有細菌中,只有12%與疾病相關。研究者還發現了三
個與腺鼠疫相關的樣本和兩個與炭疽的DNA片段相關的樣本,不過他們指出,這些樣本都
沒有活性,有很長一段時間,紐約都沒有出現過這兩種疾病的確診案例。梅森說,「紐約
州和東海岸有很多記錄在案的牲畜炭疽病例」,在紐約地鐵上發現炭疽樣本「與這一情況
吻合」。


這項研究的作者們說,進行這項研究的目的不僅是為了滿足科學家們的好奇心。研究者們
現在把這些物種歸類,將來就可以把它們用作對照樣本,以確定某些疾病甚至某些用作生
物恐怖主義武器的物質是否已擴散。


城市和交通官員們似乎並不歡迎這項研究。

「就像這項研究清楚表明的那樣,在物體表面發現的那些微生物對人的生命和健康毫無危
害,」紐約大都會運輸署發言人凱文· 奧爾蒂斯(Kevin Ortiz)在郵件中說。紐約衛生部
稱這項研究「有重大缺陷」,具有誤導性。


梅森對此的回復是,他和他的團隊只是呈現出他們的全部研究結果。

「對我們來說,在全面分析的情況下,不報告炭疽DNA片段和黑死病是不負責任的,」他
說,「我們的發現展示了一個正常、健康的微生物群,我們歡迎其他人複核這些公開發布
的數據,進行同樣的分析。」


本文最初發表於2015年2月6日。
翻譯:王相宜

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